Annotate VCF ツールの使い方

検出された SNP や indel がもたらす影響を予測する。

SnpEffは 変異に対してアノテーションとそれがもたらす効果を予測するツールです。 Annotate VCF ツールは、このプログラムを Subio Platform から簡単に実行できるようにするものです。ムービーではGZで圧縮されたファイルでもいいとなっていますが、解凍したVCFファイルでないとうまく動作しないかもしれません。

もし、解析対象の生物種用のデータベースが見つからない場合は、SnpEff用のデータベースの作成を行ってください