FASTQファイルの処理中に起こるエラーの回避方法
fastpは、通常使われるアダプター配列に対応しておりますが、特殊なキットを使っている場合にアダプター配列を認識できないことがあります。その場合は、fastpのオプション設定欄で --adapter_sequence=AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA のようアダプター配列を教えてあげてください。 また、アダプターを取り除いた後のリード配列も、ターゲット以外の...
Paired-end のRNA-SeqデータのFASTQファイルの名前の付け方
Subio Platform が正しくペア―ドエンドサンプルを見つけられないときは、FASTQファイルの名前を下のように付け直して下さい。 XXX_1.fastq.gzXXX_2.fastq.gzYYY_1.fastq.gzYYY_2.fastq.gzZZZ_1.fastq.gzZZZ_2.fastq.gz XXX, YYY, ZZZ はサンプル名、_1 と _2 はペアを表します。
Macでファイルチューザーを開くと、一つだけしか選択できません。100サンプルを一度にインポートしたいときなどはどうすればいいですか？
"Select Files"ボタンを押すと、ファイルチューザーが開きますが、Mac OSではここで一つのファイルしか選択することができません。しかし、その上の白い枠内には、複数のファイルを一度にドラッグ＆ドロップしてセットすることができます。これは、Mac OSのみで起こることが知られています。