CpG アイランドでは多くの場合脱メチル化されていることが知られています。しかし、実際の測定データを見ると多くの例外を簡単に見つけることができます。GSE97484 （DNAメチル化アレイと、H3K4me3 および H3K27ac のChIP-Seq 測定データを含むマルチオミクスのデータセット）を例にとって、DNAの脱メチル化について詳しく見てみましょう。 ゲノムブラウザー上でベータ値を棒...
はじめに Subio Platform を使えば、TCGAのRNA-SeqとDNAメチル化アレイのデータを簡単にインポートできます。（インポートの操作は、"TCGAのRNA-Seqデータをインポートする" または "TCGAのDNAメチル化データをインポートして解析する" のチュートリアルをご覧ください。） 遺伝子発現とDNAメチル化を統合解析する実践的なケーススタディを始めましょう。 それ...
TCGA-READ: analysis of the methylation alteration and survival rate. Download このチュートリアルは、下記の４つのパートで構成されます。目安の時間をあわせて表記していますので、見る必要のないところは飛ばしていただいて結構です。 Part1 '00"00 - 準備 以前投稿したTCGAのメチル化データを解析するムービ...
GSE34403は、Bisulphite Sequencing のデータと、Methylation BeadChip のデータを両方含んでいます。二つの手法から得られるデータの質を比べるのに役に立つでしょう。 Comparing Bisulphite Sequencing And Methylation Array Download 0:00 概要説明 0:10 bisulphite seq...