TCGAのRNA-Seqデータをインポートする
TCGAのRNA-Seqデータをインポートする Download Subio Platform v1.20.5009 では、TCGAまたはTARGETプロジェクトの、さまざまな癌の遺伝子発現データをGDCサイトから直接ダウンロードしてインポートすることができるようになりました。発現量データだけでなく、サンプル情報も合わせて取得されるので、データ解析や探索を簡単に始めることができます。 デー...
TCGAのRNA-Seqデータをインポートする Download Subio Platform v1.20.5009 では、TCGAまたはTARGETプロジェクトの、さまざまな癌の遺伝子発現データをGDCサイトから直接ダウンロードしてインポートすることができるようになりました。発現量データだけでなく、サンプル情報も合わせて取得されるので、データ解析や探索を簡単に始めることができます。 デー...
TCGA の miRNA-Seq データを解析する。(AMLの例) Download Subio Platformを使うと、TCGAのmiRNA-Seqのデータを簡単にインポートして、解析することができます。AMLのデータの解析例をご覧ください。
Fill Missing Values ブロックの使い方 Download Fill Missing Value を使う必要のあるデータは、その扱い方に少しクセがあるということです。特に次世代シーケンサーを使ったRNA-Seq、ChIP-Seqなどのデータや質量分析で測定したプロテオミクスデータなどには、原理的にたくさんの欠損値、または '0' が含まれています。このムービーでは、そのよう...